U.S. flag

An official website of the United States government
bit Xplor-NIH VMD-XPLOR
Pydoc: module h3JNC
 
h3JNC		 index


 
Compute h3JNC values.
 
References:
 
 M. Barfield, ``Structural dependencies of interresidue scalar
 coupling (h3)J(NC') and donor $^1$H chemical shifts in the hydrogen
 bonding regions of proteins,'' J. Am. Chem. Soc. 124, 4158-4168 (2002).
 
 H.J. Sass, F.F. Schmid and S. Grzesiek, ``Correlation of
 protein structure and dynamics to scalar couplings across hydrogen
 bonds,'' J. Am. Chem. Soc. 129, 5898-5903 (2007).

 
Classes
       
builtins.object
H3JNC

 
class H3JNC(builtins.object)
    H3JNC(h, o)
 

 
  Methods defined here:
__init__(s, h, o)
Initialize self.  See help(type(self)) for accurate signature.
calc(s)
derivs(s)
Return the gradients of the h3JNC value with respect to
h, o, c and n atoms
Data descriptors defined here:
__dict__

 
dictionary for instance variables (if defined)
__weakref__

 
list of weak references to the object (if defined)

 
Data
        a = 1
b = 3.2
c = -1.31
d = 0.62
e = 0.92
f = 0.14
g = 0
r0 = 1.76