dihedral
index
/home/schwitrs/bzr-repo/xplor-python3/bin.Linux_x86_64/dihedral.py

Helper module to display torsion angle values.
 
 
 
The dihedral angle is that defined by atoms a0, a1, a2 and a3:
 
                               a3
                              /
                        a1--a2
                       /
                     a0
 
 
A dihedral angle is represented by the class Dihedral:
 
 
Constructor:
 
   Dihedral(a0, a1, a2, a3)
 
    The arguments specify the four atoms in the dihedral angle.  Each   
    argument is an atom.Atom object, an atomSel.AtomSel object or 
    simply a string with an X-PLOR language atom selection. 
 
Methods:
 
   value() 
 
      Return the value of the dihedral angle (in radians).
 
   derivs()
 
      Return the value of the gradient of the dihedral angle for the four 
      atoms.  The return value is a tuple:
 
      (dPhidAtom0, dPhidAtom1, dPhidAtom2, dPhidAtom3)
 
      where dPhidAtomx (x = 0-3) is a vec3.Vec3 object with the x,y,z
      partial derivatives of the dihedral angle at the coordinates of atom
      ax.
 
   atom0(), atom1(), atom2(), atom3()
 
      Return the requested atom (an atom.Atom object).
 
 
 
 
 
# This file was automatically generated by SWIG (http://www.swig.org).
# Version 4.0.2
#
# Do not make changes to this file unless you know what you are doing--modify
# the SWIG interface file instead.

 
Classes
       
builtins.object
Dihedral

 
class Dihedral(builtins.object)
    Dihedral(*args, **kwargs)
 

 
  Methods defined here:
__init__(self, *args, **kwargs)
Initialize self.  See help(type(self)) for accurate signature.
__repr__ = _swig_repr(self)
atom0(self, *args, **kwargs) -> 'Atom const &'
atom1(self, *args, **kwargs) -> 'Atom const &'
atom2(self, *args, **kwargs) -> 'Atom const &'
atom3(self, *args, **kwargs) -> 'Atom const &'
derivs(self, *args) -> 'void'
pyXplorHelp(self, *args, **kwargs) -> 'String'
value(self, *args, **kwargs) -> 'float_type'

Static methods defined here:
__swig_destroy__ = delete_Dihedral(...)

Data descriptors defined here:
__dict__

 
dictionary for instance variables (if defined)
__weakref__

 
list of weak references to the object (if defined)
thisown

 
The membership flag

 
Functions
       
pyXplorHelp(*args) -> 'String'